A hónap meglehetősen csapadékos volt, országos átlagban 96 mm csapadékot regisztráltunk. A legtöbb csapadék a Dunántúlon hullott, itt jobbára 100-160 mm volt jellemző, a Bakonyban kisebb területen a 220 mm-t is meghaladta a havi összeg. A legkevesebb az Alföldön adódott, itt többnyire 60-90 mm-t összegeztünk, melytől csak kisebb foltokban maradt el a szeptemberi mennyiség. A legnagyobb havi csapadékösszeget Bakonybélben (239,3 mm) jegyeztük, míg a legkisebb havi összeg (49,7 mm) Hajdúsámson állomáson hullott.

2024 szeptemberében az országos átlag a megszokott mennyiségnek több mint másfélszerese volt, a havi mennyiség az ország minden pontján meghaladta a sokévi értéket. Csak kis területen jelentkeztek átlaghoz közeli összegek, például Debrecen, Kiskunhalas, a Tisza-tó és a Balaton térségében. A legnagyobb csapadéktöbbletek a Kisalföldön, a Bakonyban, a Mátrában és az Észak-alföldi-hordalékkúpsíkság területén, valamint a Zempléni-hegység és a Felső-Tisza-vidék nyugati részén jelentkeztek, többnyire 2-2,5-szer, a Bakony esetén pedig akár 3-szor több hullott a megszokottnál.