Szárazabb volt a szeptember a megszokottnál, miközben az ország területén jelentős különbségek adódtak. A havi csapadékösszeg országos átlagban 35,7 mm-nek adódott, amely a sokévi átlag 60%-a. A legszárazabb területek az ország közepén a Csepel-szigeten és annak közelében jelentkeztek, ami a Balatontól a Tiszáig, a Dunakanyartól Szekszárdig kiterjedő részt foglalta magába, itt 10-25 mm csapadék volt jellemző. A Nyírségben: Mátészalka és Nyírbátor környékén (10-25 mm), az Alpokalján: az Őrségi Nemzeti Parkban és Szombathely közelében (15-25 mm) hullott még nagyon kevés csapadék. A havi legalacsonyabb csapadékösszeg 8,5 mm volt Adonyban Fejér vármegyében. A legcsapadékosabb területek 50-80 mm havi csapadékösszeggel Somogy vármegyében és az Északi-középhegység magasabban fekvő területein jelentkeztek. A havi legmagasabb összeg a Somogy vármegyei Vésén jelentkezett: 94,0 mm.

Szeptemberben a lehulló csapadékmennyiségnek a normáltól vett eltérése az országon belül jelentős volt. Egyes területeken a megszokott mennyiség 10%-a, míg máshol a 150%-a hullott le. Bár volt példa nagy pozitív eltérésre, de ez csupán nagyon kis területre korlátozódott. A legjelentősebb többlet a Mátrában hullott, és Borsod-Abaúj-Zemplén, Békés és Csongrád-Csanád vármegyékben is voltak a megszokottnál nedvesebb területek (110-130%). A legnagyobb negatív anomália a Duna vonalában jelentkezett, ahol az 1991-2020-as átlag 10-40%-a érkezett a hónap során. A Balaton térségében, az Alpokalján, és a Nyírségben is mindössze a megszokott mennyiség 20-40%-a hullott.